Sateesh Kagale

 

Rôles et responsabilités

  • Chercheur scientifique, Génétique des cultures et génomique
  • Chef d'équipe, Analyse avancée des données
  • Professeur adjoint, Département des sciences végétales, Université de la Saskatchewan

Recherche et / ou projets en cours

La recherche actuelle se concentre sur l'application des technologies d'analyse et d'édition du génomique pour l'amélioration des cultures.

Énoncés de recherches / projets

  • Amélioration génétique du canola : Optimisation des caractéristiques de qualité des graines de canola, y compris la quantité, la qualité et la transformabilité des protéines, de l'huile et des fibres des graines.
  • Méiose et recombinaison: Développer des ressources génétiques et génomiques avancées pour caractériser et améliorer la recombinaison méiotique afin de créer de nouvelles combinaisons de gènes pour la sélection des cultures.
  • Séquençage de cellule unique chez les végétaux : Séquençage génomique unicellulaire à base de microspores et stratégie de génotypage pour surveiller la fréquence de recombinaison méiotique chez les plantes.
  • Plateforme d’édition génique : Plateforme d'édition de gènes adaptée aux sélectionneurs pour améliorer l'agronomie et la qualité des semences des variétés de cultures.
  • Faire progresser la domestication: exploiter la précision de l'édition de gènes dans la sélection des cultures

Études

  • Ph.D. en biologie, Western University (anciennement University of Western Ontario), Canada
  • M.Sc. en pathologie végétale, Université agricole du Tamil Nadu, India
  • B.Sc. en agriculture, Université des sciences agricoles de Dharwad, India

Affiliations

  • Société canadienne de biologie végétale
  • SynBio Canada

Prix

  • Prix pour réalisations exceptionnelles en science, Agriculture et Agroalimentaire Canada (2017)
  • Prix de reconnaissance de l’excellence en leadership, Centre de recherche en développement des cultures et des ressources aquatiques (2016)
  • Prix Moisson d’or, Agriculture et Agroalimentaire Canada (2015)
  • Bourse de recherche scientifique du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG) (2008-2010)
  • Bourse d’études supérieures de l’Ontario, ministère de la Formation et des Collèges et Universités (2005-2006)
  • Bourse du recteur pour les études supérieures, University of Western Ontario (2002-2003)
  • Médaillé d'or, Université agricole du Tamil Nadu (2002)
  • Médaillé d'or, Université des sciences agricoles de Dharwad (1999)

Principales publications

  • Lyzenga, W.J., Pozniak, C.J., and Kagale, S. (2021). Advanced domestication: harnessing the precision of gene editing in crop breeding (Domestique avancée : exploiter la précision de l'édition de gènes dans la sélection des cultures). Plant Biotechnology Journal 19, 660-670.
  • Lyzenga, W.J., and Kagale, S. (2021). Wheat improvement using genome editing technology (Amélioration du blé à l'aide de la technologie d'édition du génome). BioTechniques 71:577-579.
  • Gao, P., Quilichini, T.D., Yang, H., Li, Q., Nilsen, K.T., Qin, L., Babic, V., Liu, L., Cram, D., Pasha, A., Esteban, E., Condie, J., Sidebottom, C., Zhang, Y., Huang, Y., Zhang, W., Bhowmik, P., Kochian, L.V., Konkin, D., Wei, Y., Provart, N.J., Kagale, S., Smith, M., Patterson, N., Gillmor, C.S., Datla, R., and Xiang, D. (2021). Evolutionary divergence in embryo and seed coat development of U’s Triangle Brassica species illustrated by a spatiotemporal transcriptome atlas (Divergence évolutive dans le développement de l'embryon et du tégument des espèces de Brassica du Triangle de U illustrée par un atlas spatio-temporel du transcriptome). New Phytologist 233:30-51.
  • Kagale, S. and Close T.J. (2021) Legume: Embracing the Genome Era (Légumineuse : embrasser l'ère du génome). Legume Science 3: e113.
  • Bhowmik, P., Konkin, D., Polowick, P., Hodgins, C.L., Subedi, M., Xiang, D., Yu, B., Patterson, N., Rajagopalan, N., Babic, V., Ro, D.-K., Tar'an, B., Bandara, M., Smyth, S.J., Cui, Y., and Kagale, S. (2021). CRISPR/Cas9 gene editing in legume crops: Opportunities and challenges (Édition de gènes CRISPR/Cas9 dans les cultures de légumineuses : opportunités et défis). Legume Science 3: e96.
  • Moghaddam, S.M., Oladzad, A., Koh, C., Ramsay, L., Hart, J.P., Mamidi, S., Hoopes, G., Sreedasyam, A., Wiersma, A., Zhao, D., Grimwood, J., Hamilton, J.P., Jenkins, J., Vaillancourt, B., Wood, J.C., Schmutz, J., Kagale, S., Porch, T., Bett, K.E., Buell, C.R., and McClean, P.E. (2021). The tepary bean genome provides insight into evolution and domestication under heat stress (Le génome du haricot tépari donne un aperçu de l'évolution et de la domestication sous stress thermique). Nature communications 12, 2638.
  • Walkowiak, S., Gao, L., Monat, C., Haberer, G., Kassa, M.T..…Kagale, S…..Pozniak, C.J. (2020). Multiple wheat genomes reveal global variation in modern breeding (Plusieurs génomes de blé révèlent des variations mondiales dans la sélection moderne). Nature. 588, 277-283.
  • Perumal, S., Koh, C.S., Jin, L., Buchwaldt, M., Higgins, E.E., Zheng, C., Sankoff, D., Robinson, S.J., Kagale, S., Navabi, Z.-K., Tang, L., Horner, K.N., He, Z., Bancroft, I., Chalhoub, B., Sharpe, A.G., and Parkin, I.A.P. (2020). A high-contiguity Brassica nigra genome localizes active centromeres and defines the ancestral Brassica genome (Un génome de Brassica nigra à haute contiguïté localise les centromères actifs et définit le génome ancestral de Brassica). Nature Plants 6, 929-941.
  • Cram, D., Kulkarni, M., Buchwaldt, M., Rajagopalan, N., Bhowmik, P., Rozwadowski, K., Parkin, I.A.P., Sharpe, A.G., and Kagale, S. (2020). WheatCRISPR: a web-based guide RNA design tool for CRISPR/Cas9-mediated genome editing in wheat (WheatCRISPR : un outil de conception d'ARN guide basé sur le Web pour l'édition du génome médiée par CRISPR/Cas9 chez le blé). BMC Plant Biology 19, 474.
  • Huang D., Zheng Q., Melchkart T., Bekkaoui Y., Konkin D.J.F., Kagale S., Martucci M., You FM., Clarke M., Adamski N.M., Chinoy C., Steed A., McCartney C., Cutler A.J., Nicholson P., Feurtado J.A. (2020). Dominant Inhibition of Awn Development by a Zinc-Finger Transcriptional Repressor Expressed at the B1 Locus in Wheat (Inhibition dominante du développement des arêtes par un répresseur transcriptionnel à doigt de zinc exprimé au locus B1 chez le blé). New Phytologist 225: 340-355.
  • Shunmugam, A.S.K., Bollina, V., Dukowic-Schulze, S., Bhowmik, P.K., Ambrose, C., Higgins, J.D., Pozniak, C., Sharpe, A.G., Rozwadowski, K., et Kagale, S. (2018). MeioCapture: an efficient method for staging and isolation of meiocytes in the prophase I sub-stages of meiosis in wheat (MéioCapture : une méthode efficace pour la stadification et l’isolement des méiocytes dans les sous-stades de la prophase I de la méiose chez le blé). BMC plant biology, 18: 293.
  • Bhowmik, P., Ellison, E., Polley, B., Bollina, V., Kulkarni, M., Ghanbarnia, K., Song, H., Gao, C., Voytas, D.F., et Kagale, S. (2018). Targeted mutagenesis in wheat microspores using CRISPR/Cas9 (mutagenèse ciblée dans les microspores de blé à l’aide de la technique CRISPR-Cas9. Rapports scientifiques). Rcientific reports, 8: 6502.
  • Kulkarni, M., Soolanayakanahally, R., Ogawa, S., Uga, Y., Selvaraj, M.G., et Kagale, S. (2017). Drought response in wheat: key genes and regulatory mechanisms controlling root system architecture and transpiration efficiency (réaction à la sécheresse chez le blé : principaux gènes et mécanismes de régulation contrôlant l’architecture du système radiculaire et l’efficience de la transpiration). Frontiers in Chemistry, 5: 106.
  • Kagale, S., Nixon, J., Khedikar, Y., Pasha, A., Provart, N.J., Clarke, W.E., Bollina, V., Robinson, S.J., Coutu, C., Hegedus, D.D., Sharpe, A.G., et Parkin, I.A. (2016). The developmental transcriptome atlas of the biofuel crop Camelina sativa (l’atlas des transcriptomes de développement de la culture pour biocarburants Camelina sativa). Plant journal, 88: 879-894.
  • Kagale, S., Robinson, S.J., Nixon, J., Xiao, R., Huebert, T., Condie, J., Kessler, D., Clarke, W.E., Edger, P.P., Links, M.G., Sharpe, A.G., et Parkin, I.A. (2014). Polyploid evolution of the Brassicaceae during the Cenozoic era (évolution polyploïde des brassicacées au cours de l’ère cénozoïque). Plant cell, 26: 2777-2791.
  • Kagale, S., Koh, C., Nixon, J., Bollina, V., Clarke, W.E., Tuteja, R., Spillane, C., Robinson, S.J., Links, M.G., Clarke, C., Higgins, E.E., Huebert, T., Sharpe, A.G., et Parkin, I.A. (2014). The emerging biofuel crop Camelina sativa retains a highly undifferentiated hexaploid genome structure (la nouvelle culture pour biocarburants Camelina sativa conserve une structure très indifférenciée du génome hexaploïde). Nature communications, 5: 3706.
  • Parkin, I.A., Koh, C., Tang, H., Robinson, S.J., Kagale, S., Clarke, W.E., Town, C.D., Nixon, J., Krishnakumar, V., Bidwell, S.L., Denoeud, F., Belcram, H., Links, M.G., Just, J., Clarke, C., Bender, T., Huebert, T., Mason, A.S., Pires, J.C., Barker, G., Moore, J., Walley, P.G., Manoli, S., Batley, J., Edwards, D., Nelson, M.N., Wang, X., Paterson, A.H., King, G., Bancroft, I., Chalhoub, B., et Sharpe, A.G. (2014). Transcriptome and methylome profiling reveals relics of genome dominance in the mesopolyploid Brassica oleracea (l’établissement du profil du transcriptome et du méthylome révèle des vestiges de dominance du génome chez le mésopolyploïde Brassica oleracea). Genome biology, 15: R77.
  • Borg, M., Rutley, N., Kagale, S., Hamamura, Y., Gherghinoiu, M., Kumar, S., Sari, U., Esparza-Franco, M.A., Sakamoto, W., Rozwadowski, K., Higashiyama, T., et Twell, D. (2014). An EAR-Dependent Regulatory Module Promotes Male Germ Cell Division and Sperm Fertility in Arabidopsis (un module de régulation dépendant du motif EAR favorise la division des cellules germinales mâles et la fertilité des gamètes mâles chez Arabidopsis). Plant cell, 26: 2098-2113.
  • Kagale, S., et Rozwadowski, K. (2011). EAR motif-mediated transcriptional repression in plants: an underlying mechanism for epigenetic regulation of gene expression (la répression de la transcription médiée par le motif EAR chez les végétaux : un mécanisme sous-jacent de régulation épigénétique de l’expression génique). Epigenetics, 6: 141-146.
  • Kagale, S., Links, M.G., et Rozwadowski, K. (2010). Genome-wide analysis of ethylene-responsive element binding factor-associated amphiphilic repression motif-containing transcriptional regulators in Arabidopsis (analyse de l’ensemble du génome des régulateurs de la transcription contenant des motifs de répression amphiphile associée au facteur de liaison à l’élément sensible à l’éthylène [motifs EAR] chez Arabidopsis). Plant physiology, 152: 1109-1134.
Sateesh Kagale

Sateesh Kagale

Agent(e) de recherches associé(e)
Développement des cultures et des ressources aquatiques
110, place Gymnasium
Saskatoon, Saskatchewan S7N 0W9
Langue préférée : anglais
Téléphone : 306-975-4194

Suivez-moi

Expertise

Agriculture, Génomique