Traian Sulea

Rôles et responsabilités

  • Chef de l’équipe de modélisation moléculaire du CNRC (Département d’immunobiologie, Centre de recherche en thérapeutique en santé humaine)
  • Chef des projets financés par le CNRC sur la biothérapeutique dans le cadre de la lutte contre la COVID-19 (Bureau national des programmes du CNRC)
  • Membre du Comité consultatif du président sur l’excellence en recherche du CNRC (2020-2023)

Recherche et / ou projets en cours

Fort d’un solide bagage dans les domaines de la biochimie, de la chimie organique et de la chimie physique, je suis un chimiste-informaticien réputé qui possède 25 ans d’expérience ainsi qu’une vaste expertise dans la modélisation moléculaire appliquée à la recherche biopharmaceutique; de la découverte de petites molécules fondée sur la chimio-informatique à la biologie computationnelle fondée sur la bio-informatique structurelle, et des simulations moléculaires de complexes protéine-ligand à l’ingénierie de protéines thérapeutiques et à l’humanisation des anticorps.

Énoncés de recherches / projets

  • A étudié un large éventail de cibles moléculaires, y compris les enzymes cytosoliques (particulièrement les protéases à cystéine), les domaines récepteurs extracellulaires (tout particulièrement les récepteurs de facteurs de croissance) et les protéines sécrétées d’origine virale, bactérienne, parasitaire, fongique, végétale et mammalienne.
  • Porte un intérêt profond à l’avancement des méthodes computationnelles pour les applications biomoléculaires, étant particulièrement actif dans l’élaboration de modèles de solvatation et de l’affinité de liaison pour les interactions protéine-ligand.
  • Actif dans l’application de la modélisation structurelle computationnelle à la conception de protéines thérapeutiques, ce qui a mené à l’obtention d’une propriété intellectuelle de divers produits biologiques, y compris les pièges pour facteurs de croissance à chaîne unique, les anticorps améliorés avec un ciblage différentiel de tissus normaux et tumoraux et les anticorps humanisés.
  • A contribué à l’élaboration d’une plateforme in silico pour une conception de novo et maturation d’affinité d’anticorps thérapeutiques.
  • A mené à des avancées et à des découvertes biothérapeutiques dans la lutte contre les infections à la COVID-19 et les blessures aux organes connexes.

Études

  • Postdoctorat, Modélisation moléculaire, CRSNG, CNRC (1997)
  • Doctorat, Chimie physique, Université de l’Ouest de Timisoara, Roumanie (1995)
  • Maîtrise, Chimie organique, Université Polytechnique de Timisoara, Roumanie (1993)

Activités professionnelles / intérêts

  • Professeur adjoint depuis 2012 à l’Institut de parasitologie de l’Université McGill; enseigne les cours de niveau supérieur « Structural Bioinformatics » (BTEC555, Hiver) et « Therapeutic Antibody Design » (BTEC650, automne).
  • Instructeur depuis 2017 au Cambridge Healthtech Institute (États-Unis); donne des séminaires de formation et des cours lors d’événements internationaux (PEGS Boston et PepTalk San Diego).
  • Membre du Conseil consultatif de rédaction de la section Biologie moléculaire de l’International Journal of Molecular Sciences depuis 2021.

Affiliations

Membre de l’American Chemical Society

Member du conseil de rédaction, International Journal of Molecular Sciences, MDPI

Member du conseil de rédaction, Current Computer-Aided Drug Design, Bentham Science (2005-2009)

 

Prix

  • Prix du CNRC pour réalisations exceptionnelles en 2022 – catégorie Protéger nos clients
  • Prix du CNRC pour la propriété intellectuelle de 2020 – catégorie Retombées d’une PI
  • Prix du CNRC pour réalisations exceptionnelles en 2020 – catégorie Valeur pour le Canada
  • Prix d’excellence de TSH – catégorie Valeurs du CNRC
  • Prix du CNRC pour réalisations exceptionnelles en 2016 – catégorie Découverte scientifique et technologique
  • Prix du CNRC pour réalisations exceptionnelles en 2009 – catégorie Partenariats
  • Prix du directeur général du CNRC-IRB de 2008 – catégorie Transfert de technologie
  • Prix du directeur général du CNRC-IRB de 2005 – catégorie Science

Inventions et brevets

35. Sulea, Traian; Marcil, Anne; Jaramillo, Maria; Moreno, Maria; Wu, Cunle; et al. EGFRvIII-targeted compounds and uses thereof. PCT/CA2021/051360, filed 29-9-2021.

34. Sulea, Traian; Marcil, Anne; Jaramillo, Maria; Moreno, Maria; Wu, Cunle. Humanized anti-EGFRvIII antibodies and antigen-binding fragments thereof. PCT/IB2021/058954, filed 29-9-2021.

33. Sulea, Traian; Durocher, Yves. ACE2-receptor ectodomain fusion molecules and uses thereof. PCT/IB2022/050650, filed 25-1-2022. WO/2022/162533, published 4-8-2022.

32. Sulea, Traian; Zwaagstra, John; Baardsnes, Jason; Corbeil, Christopher; Jaramillo, Maria Luz; Purisima, Enrico; Rohani Larijani, Nazanin. Antibody variants with pH-dependent antigen binding for selective targeting of solid tumors. PCT/IB2020/053024, filed 30-3-2020. WO/2020/201992, published 8-10-2020.

31. Marcil, Anne; McComb, Scott; Weeratna, Risisni; Sulea, Traian; Jaramillo, Maria Luz; Wu, Cunle; Bloemberg, Darin. Anti-EGFRvIII antibodies and antigen-binding fragments thereof. PCT/CA2020/050378, filed 3-3-2020. WO/2020/191486, published 1-10-2020.

30. Marcil, Anne; Jaramillo, Maria Luz; Moreno; Maria, Sulea, Traian. Antigen-binding agents that specifically bind epidermal growth factor receptor variant III. PCT/CA2020/050376, filed 3-3-2020. WO/2020/191485, published 1-10-2020.

29. Smith, Benjamin A.; Lehmann, Andreas; Cameron, Thomas, O.; Pepinsky, R., Blake; Wen, D.; Farrington, Graham, K.; Raghunathan, Gopalan; Pederson, Nels, E.; Stanimirovic, Danica; Sulea, Traian; Haqqani, Arsalan, S. Humanized and stabilized FC5 variants for enhancement of blood brain barrier transport. PCT/US2019/058286, filed 28-10-2019. WO/2020/092202, published 7-5-2020.

28. Hussack, Gregory; Tanha, Jamshid; Henry, Kevin; Sulea, Traian. Serum albumin binding antibodies for tunable half-life extension of biologics. PCT/CA2019/050514, filed 24-4-2019. WO/2019/204925, published 31-10-2019.

27. Martina, Marzia; Chakravarthy, Balu; Durocher, Yves; Marcil, Anne; Arbabi Garhoudi, Mehdi; Sulea, Traian; Bandareli, Umberto; Moreno, Maria, Stanimirovic, Danica. Antibodies and antibody fragments against hNav1.7 channel and their use in pain and cancer indications. PCT/CA2019/050676, filed 17-5-2019. WO/2019/218082, published 21-11-2019.

26. Gilbert, Michel; Sulea, Traian; Jaramillo, Maria, L.; Durocher, Yves; Acchione, Maurizio. Antibody glycoconjugates and methods of production and use. PCT/CA2018/051410, filed 8-11-2018. WO/CA2019/090424, published 16-5-2019.

25. Sulea, Traian; Hussack, Greg; Tanha, Jamshid; Purisima, Enrico. Clostridium Difficile-specific antibodies and uses thereof. PCT/IB2018/055047, filed 9-7-2018. WO/2019/012406, published 17-1-2019.

24. Zwaagstra, John, C.; Sulea, Traian; Jaramillo, Maria; O’Connor, Maureen, D.; Lenferink, Anne, E.G. TGF-b-receptor ectodomain fusion molecules and uses thereof. PCT/IB2018/051320, filed 1-3-2018. WO/2018/158727, published 7-9-2018.

23. Moffett, Serge; Sulea, Traian. Anti-PSMA antibodies and uses thereof for diagnostic and therapeutic applications. PCT/IB2018/050644, filed 1-2-2018. WO/2018/142323, published 9-8-2018.

22. Stanimirovic, Danica; Sulea, Traian; Kemmerich, Kristin; Wilson, David; Stratton, Jennifer; Pollard, Matthew; Clarke, Adam. Antibody variants transmigrating the blood-brain barrier and uses thereof. PCT/IB2017/057844, filed 12-12-2017. WO/2018/109663, published 21-6-2018. US patent 11,906,973, issued 2-2-2021.

21. Hinck, Andrew P.; Sulea, Traian. Engineered TGF-beta monomers and their use for inhibiting TGF-beta signaling. PCT/US2017/062233, filed 17-11-2017. WO/2018/094173, published 24-5-2018. US patent 11,091,523, issued 17-8-2021.

20. Stanimirovic, Danica; Kemmerich, Kristin; Durocher, Yves; Sulea, Traian. Humanized antibodies transmigrating the blood-brain barrier and uses thereof. PCT/IB2017/054036, filed 4-7-2017. WO/2018/007950, published 11-1-2018. US patent 10,738,115, issued 11-08-2020.

19. Zwaagstra, John, C.; Sulea, Traian; Jaramillo, Maria; O’Connor, Maureen, D.; Lenferink, Anne, E.G. TGF-b-receptor ectodomain fusion molecules and uses thereof. PCT/IB2016/055204, filed 31-8-2016. WO/2017/037634, published 9-3-2017.

18. Tessier, Philippe; Tardif, Melanie; Sulea, Traian. Humanized anti-S100A9 antibody and uses thereof. PCT/CA2016/050810, filed 11-7-2016. WO/2017/008153, published 19-1-2017, US patent 11,359,010, issued 14-06-2022.

17. Stanimirovic, Danica; Kemmerich, Kristin; Haqqani, Arsalan S.; Sulea, Traian; Arbabi-Ghahroudi, Mehdi; Massie, Bernard; Gilbert, Rénald. Insulin-like growth factor 1 receptor-specific antibodies and uses thereof. PCT/CA2014/000862, filed 04-12-2014, WO/2015/131258, published 11-9-2015. US patent 10,100,117, issued 16-10-2018.

16. Stanimirovic, Danica; Kemmerich, Kristin; Haqqani, Arsalan S.; Sulea, Traian; Arbabi-Ghahroudi, Mehdi; Massie, Bernard; Gilbert, Rénald. Insulin-like growth factor 1 receptor-specific antibodies and uses thereof. PCT/CA2014/000861, filed 04-12-2014, WO/2015/131257, published 11-9-2015. US patent 10,112,998, issued 30-10-2018. European patent EP3114141, granted 6-5-2020.

15. Stanimirovic, Danica; Kemmerich, Kristin; Haqqani, Arsalan S.; Sulea, Traian; Arbabi-Ghahroudi, Mehdi; Massie, Bernard; Gilbert, Rénald. Insulin-like growth factor 1 receptor-specific antibodies and uses thereof. PCT/CA2014/000860, filed 04-12-2014, WO/2015/131256, published 11-9-2015. US patent 10,106,614, issued 23-10-2018. European patent EP3114140, granted 27-2-2019.

14. Stuible, Matthew; Tremblay, Gilles B.; Sulea, Traian; Moraitis, Anna N.; Filion, Mario. Anti-SIGLEC-15 antibodies. PCT/CA2013/000646, filed 17-7-2013. WO/2014/012165, published 23-1-2014. US patent 9,493,562, issued 15-11-2016. European patent EP2875051, granted 20-2-2019.

13. Brodt, Pnina; Massie, Bernard; Sulea, Traian. Soluble IGF receptor Fc fusion proteins and uses thereof. PCT/CA2012/050899, filed 14-12-2012. WO/2013/086636, published 20-6-2013. European patent EP2791338, granted 20-2-2019. US patent 10,538,575, issued 21-1-2020.

12. Tremblay, Gilles B.; Moraitis, Anna; Sulea, Traian; Filion, Mario. Antibodies against kidney associated antigen 1 and antigen binding fragments thereof. PCT/CA2012/000296, filed 28-3-2012. WO/2012/129668, published 4-10-2012. US patent 8,937,163, issued 20-1-2015, US patent 9,393,302, issued 19-7-2016. US patent 9,828,426, issued 28-11-2017. US patent 10,597,450, issued 24-3-2020. European patent EP2691421, granted 9-11-2016. Australian patent AU2012234754, granted 12-1-2017.

11. Tikhomirov, Ilia, A.; Jaramillo, Maria, L.; O’Connor-McCourt, Maureen, D.; Sulea, Traian; Gilbert, Renald; Gaillet, Bruno; Baardsnes, Jason; Banville, Myriam. Antibodies selective for cells presenting EGFR at high density. PCT/CA2012/050034, filed 20-1-2012. WO/2012/100346, published 2-8-2012. US patent 10,570,211, issued 25-2-2020.

10. Tikhomirov, Ilia, A.; Jaramillo, Maria, L.; O’Connor-McCourt, Maureen, D.; Sulea, Traian; Gilbert, Renald; Gaillet, Bruno; Baardsnes, Jason; Banville, Myriam. Antibodies selective for cells presenting erbB2 at high density. PCT/CA2011/050747, filed 2-12-2011. WO/2012/075581, published 14-6-2012. US patent 10,208,129, issued 19-2-2019.

9. Zwaagstra, John, C.; O'Connor-McCourt, Maureen, D.; Sulea, Traian; Collins, Catherine; Banville, Myriam. Covalently dimerized bivalent binding agents. PCT/CA2011/001306, filed 28-11-2011. WO/2012/071649, published 7-6-2012. US patent 8,987,417, issued 24-3-2015. European patent EP2646472, granted 30-8-2017.

8. Tremblay, Gilles B.; Filion, Mario; Sulea, Traian. Anti-clusterin antibodies and antigen binding fragments and their use to reduce tumor volume. PCT/CA2010/001882, filed 24-11-2010. WO/2011/063523, published 3-6-2011. US patent 8,802,866, issued 12-8-2014. US patent 9,512,211, issued 6-12-2016.

7. Tremblay, Gilles B.; Filion, Mario; Sulea, Traian. Antibodies that specifically block the biological activity of kidney associated antigen 1. PCT/CA2010/001795, filed 3-11-2010. WO/2011/054112, published 12-5-2011.

6. Tremblay, Gilles B.; Filion, Mario; Sulea, Traian. Antibodies that specifically block the biological activity of a tumor antigen. PCT/CA2009/001586, filed 3-11-2009. WO/2010/060186, published 3-6-2010. US patent 9,855,291, issued 2-1-2018.

5. O'Connor-McCourt, Maureen, D.; Sulea, Traian; Zwaagstra, John; Baardsnes, Jason; Collins, Catherine. Hetero-multivalent binding agents for members of the TGFb superfamily. PCT/CA2009/001293, filed 17-9-2009. WO/2010/031168, published 25-3-2010. US patent 8,658,135, issued 25-2-2014.

4. O'Connor-McCourt, Maureen, D.; Sulea, Traian; Zwaagstra, John; Baardsnes, Jason. Antagonists of ligands and uses thereof. PCT/CA2008/000547, filed 19-3-2008. WO/2008/113185, published 25-9-2008. US Patent 8,318,135, issued 27-11-2012. US Patent 8,574,548, issued 5-11-2013. US Patent 8,734,760, issued 27-5-2014. European patent EP2140005, granted 11-12-2013.

3. Lindner, Holger A.; Menard, Robert; Sulea, Traian. Variants of aminoacylase, nucleic acids coding same, and uses thereof. WO 04/113524. Filed 23-6-2004.

2. Sulea, Traian; Purisima, Enrico O.; Menard, Robert; Wang, Jing. Non-covalent inhibitors of cysteine proteases with a tripeptide backbone. WO 03/097664. Filed 15-5-2003.

1. Menard, Robert; Nagler, Dorit K.; Sulea, Traian. Development of an in vivo functional assay for proteases. US 10/462,645; CAN 2,432,676. Filed 17-6-2003.

Principales publications

Sulea, T., Deprez, C.; Corbeil, C.R.; Purisima, E.O. Optimizing antibody-antigen binding affinities with the ADAPT platform. Methods Mol. Biol. 2552: 361-373 (2023).

Gaudreault, F.; Corbeil, C.R.; Purisima, E.O.; Sulea, T. Coevolved canonical loops conformations of single-domain antibodies: A tale of three pockets playing musical chairs. Front. Immunol. 13: 884132 (2022).

Wei, W.; Corbeil, C.R.; Gaudreault, F.; Deprez, C.; Purisima, E.O.; Sulea, T. Antibody mutations favoring pH-dependent binding in solid tumor microenvironments: Insights from large-scale structure-based calculations. Proteins 19: 1538-1546 (2022).

Sulea, T.; Baardsnes, J.; Stuible, M.; Rohani, N.; Tran, A.; Parat, M.; Cepero-Donates, Y.; Duchesne, M.; Plante, P.; Kour, G.; Durocher, Y. Structure-based dual affinity optimization of a SARS-CoV-1/2 cross-reactive single-domain antibody. PLoS One 17: e0266250 (2022).

Sulea, T. Humanization of camelid single-domain antibodies. Methods Mol. Biol. 2446: 299-312 (2022).

Sulea, T.; Rohani, N.; Baardsnes, J.; Corbeil, C.R.; Deprez, C.; Cepero-Donates, Y.; Robert, A.; Schrag J.D.; Parat, M.; Duchesne, M.; Jaramillo, M.L.; Purisima, E.O.; Zwaagstra, J.C. Structure-based engineering of pH-dependent antibody binding for selective targeting of solid-tumor microenvironment. MAbs 12: 1682866 (2020).

Schrag J.D.; Picard, M.-E.; Gaudreault, F.; Gagnon, L.-P.; Baardsnes, J.; Manenda, M.S.; Sheff, J.; Deprez, C.; Baptista, C.; Hogues, H.; Kelly, J.F.; Purisima, E.O.; Shi, R.; Sulea, T. Binding symmetry and surface flexibility mediate antibody self-association. MAbs 11: 1300-1318 (2019).

Hill, J.J.; Tremblay, T.-L.; Corbeil, C.R.; Purisima, E.O.; Sulea, T. An accurate TMT-based approach to quantify and model lysine susceptibility to conjugation via N-hydroxysuccinimide esters in a monoclonal antibody. Sci. Rep. 8: 17680 (2018).

Sulea, T.; Hussack, G.; Ryan, S.; Tanha, J.; Purisima, E.O. Application of Assisted Design of Antibody and Protein Therapeutics (ADAPT) improves efficacy of a Clostridium difficile toxin A single-domain antibody. Sci. Rep. 8: 260 (2018).

Sulea, T.; Vivcharuk, V.; Corbeil, C.R.; Deprez, C.; Purisima, E.O. Assessment of solvated interaction energy function for ranking antibody-antigen binding affinities. J. Chem. Inf. Model. 56: 1292-1303 (2016).

Sulea, T.; Purisima, E.O. The solvated interaction energy method for scoring binding affinities. Methods Mol. Biol. 819: 295-303 (2012).

Sulea, T.; Cui, Q.; Purisima, E.O. Solvated interaction energy (SIE) for scoring protein-ligand binding affinities. 2. Benchmark in the CSAR-2010 scoring exercise. J. Chem. Inf. Model. 51: 2066-2081 (2011).

Zhu, X.; Menard, R.; Sulea, T. High incidence of ubiquitin-like domains in human ubiquitin-specific proteases. Proteins 69: 1-7 (2007).

Sulea, T.; Lindner, H.A.; Purisima, E.O.; Menard, R. Deubiquitination, a new function of the severe acute respiratory syndrome coronavirus papain-like protease? J. Virol. 79: 4550-4551 (2005).

Sulea, T.; Purisima, E.O. Optimizing ligand charges for maximum binding affinity. A solvated interaction energy approach. J. Phys. Chem. B 105: 889-899 (2001).

Nagler, D.K.; Zhang, R.; Tam, W.; Sulea, T.; Purisima, E.O.; Menard, R. Human cathepsin X: A cysteine protease with unique carboxypeptidase activity. Biochemistry 38: 12648-12654 (1999).

Traian Sulea

Traian Sulea

Agent(e) recherches principal(e)
Thérapeutique en santé humaine
6100, avenue Royalmount
Montreal, Quebec H4P 2R2
Langue préférée : anglais
Autre(s) : français, roumain
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